Hacia un nuevo modelo celular
Hacia un nuevo modelo celular Convertir las grandes cantidades de información genómica en información útil para el estudio de la célula constituye un gran reto para la bioinformática, con grandes implicaciones para la biología y medicina. Investigadores de Universidad de California, Escuela de Medicina de San Diego, han propuesto un nuevo método de “ontología extraída de la red” (NeXO) que crea un modelo computacional de la célula a partir de grandes redes de interacciones entre genes y proteínas, descubriendo así la manera en que genes y proteínas se conectan para formar una máquina celular de más alto nivel. “Nuestro método crea una ontología, o una especificación de todos los componentes principales en la célula y la interrelación entre ellos”, indicó Janusz Dutkowski. Utiliza el conocimiento sobre como interactúan entre sí genes y proteínas y automáticamente organiza esta información para formar un catálogo muy completo de funciones y componentes celulares, así como los procesos que se dan. “Lo que es nuevo en nuestra ontología es que se crea automáticamente a partir de grandes grupos de datos. De esta manera, vemos no solamente lo que ya sabemos, sino potencialmente también nuevos componentes y procesos biológicos -las bases para nuevas hipótesis”, dijo Dutkowski. Originalmente usadas por filósofos con la intención de explicar la naturaleza de la existencia, las ontologías ahora son ampliamente utilizadas para encapsular de manera jerárquica todo lo que se...
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